Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms