Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms