Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms