Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P10404 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P10404 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P10404 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P10404 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms