Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PolP10400 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PolP10400 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PolP10400 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms