Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Myod1P10085 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms