Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CatspereP0DP43 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms