Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtaP09225 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtaP09225 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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