Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
TtrP07309 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms