Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-Eb1P04230 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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H2-Eb1P04230 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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