Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P01645 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01645 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01645 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms