Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Foxq1O70220 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms