Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rdh16O54909 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rdh16O54909 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh16O54909 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh16O54909 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rdh16O54909 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rdh16O54909 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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