Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc27a2O35488 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc27a2O35488 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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