Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms