Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Q1O19441 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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H2-Q1O19441 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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H2-Q1O19441 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Q1O19441 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 354.1 ms