Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms