Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms