Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms