Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ascl4M0QW46 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms