Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms