Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms