Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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