Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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