Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20825J3QM67 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms