Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6594J3QM43 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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