Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21244J3QK38 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms