Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms