Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms