Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms