Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms