Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rnf148G3X9R7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf148G3X9R7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf148G3X9R7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf148G3X9R7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rnf148G3X9R7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf148G3X9R7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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