Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Acox2-201ENSMUST00000022271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nell2-201ENSMUST00000075275 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms