Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4E9QAP7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms