Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3020E9Q3J7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms