Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Susd1E9Q3H4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms