Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vmn1r68E9Q0V3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms