Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc1E9Q043 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms