Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ryr1E9PZQ0 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms