Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brd1E9PZ26 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd1E9PZ26 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms