Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc17E9PVB5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc17E9PVB5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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