Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syde2E9PUP1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms