Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms