Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms