Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap58B2RW38 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfap58B2RW38 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms