Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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