Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rd3lB2RV38 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms