Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms