Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms