Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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H2-M5A7VMS3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M5A7VMS3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M5A7VMS3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M5A7VMS3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M5A7VMS3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M5A7VMS3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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H2-M5A7VMS3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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